Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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RRN3P1Q2M238 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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RRN3P1Q2M238 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RRN3P1Q2M238 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RRN3P1Q2M238 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RRN3P1Q2M238 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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