Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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EXT1Q16394 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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EXT1Q16394 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXT1Q16394 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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