Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM28Q13263 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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