Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.62□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 RPL29YFR032C-A 180 nt2.62□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YJR023CYJR023C 402 nt2.62□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 RLP24YLR009W 600 nt2.62□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 NDD1YOR372C 1665 nt2.62□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 MLH1YMR167W 2310 nt2.62□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 PUT3YKL015W 2940 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 MRP10YDL045W-A 288 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YDR509WYDR509W 348 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 RAD6YGL058W 519 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 LRP1YHR081W 555 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 RSA1YPL193W 1146 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 UBP15YMR304W 3693 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 PRK1YIL095W 2433 nt2.61□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.6□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 HYR1YIR037W 492 nt2.6□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 UTP30YKR060W 825 nt2.6□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 AFR1YDR085C 1863 nt2.6□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 CRD1YDL142C 852 nt2.59□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 snR84snR84 550 nt2.59□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YLR202CYLR202C 327 nt2.59□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 RPS17AYML024W 411 nt2.59□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
RTP1Q12751 GIP3YPL137C 3831 nt2.59□□□□□ -2
RTP1Q12751 SCEIQ0160 708 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 YIL029CYIL029C 429 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 YIL058WYIL058W 285 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 IST3YIR005W 447 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 ATP7YKL016C 525 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 SHE2YKL130C 741 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 ATP3YBR039W 936 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 UBP11YKR098C 2154 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 PHO91YNR013C 2685 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 RTT10YPL183C 3042 nt2.58□□□□□ -2
RTP1Q12751 KAP123YER110C 3342 nt2.57□□□□□ -2
RTP1Q12751 RRP6YOR001W 2202 nt2.57□□□□□ -2
RTP1Q12751 ESL2YKR096W 3588 nt2.57□□□□□ -2
RTP1Q12751 RAM2YKL019W 951 nt2.57□□□□□ -2
RTP1Q12751 ARV1YLR242C 966 nt2.57□□□□□ -2
RTP1Q12751 MEI5YPL121C 669 nt2.57□□□□□ -2
RTP1Q12751 ARP8YOR141C 2646 nt2.57□□□□□ -2
RTP1Q12751 FMP16YDR070C 282 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 YFR056CYFR056C 369 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 STE18YJR086W 333 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 YLR379WYLR379W 375 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 RCN2YOR220W 798 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 TRS20YBR254C 528 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 IRA2YOL081W 9240 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 SSF1YHR066W 1362 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 PTC5YOR090C 1719 nt2.56□□□□□ -2
RTP1Q12751 YDL187CYDL187C 330 nt2.55□□□□□ -2
RTP1Q12751 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.55□□□□□ -2
RTP1Q12751 YOR055WYOR055W 435 nt2.55□□□□□ -2
RTP1Q12751 SMC6YLR383W 3345 nt2.55□□□□□ -2
RTP1Q12751 REV1YOR346W 2958 nt2.55□□□□□ -2
RTP1Q12751 MSB1YOR188W 3414 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 AFI1YOR129C 2682 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 CHZ1YER030W 462 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 YJR141WYJR141W 1044 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 UBX4YMR067C 1251 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 VTI1YMR197C 654 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 MGR1YCL044C 1254 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 SPF1YEL031W 3648 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 CLN3YAL040C 1743 nt2.54□□□□□ -2
RTP1Q12751 MSL5YLR116W 1431 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 BI4Q0120 1917 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 YDL016CYDL016C 303 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 RPS24AYER074W 408 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 BET4YJL031C 984 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 YLR458WYLR458W 381 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 SAS2YMR127C 1017 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 YPL039WYPL039W 951 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 YPR096CYPR096C 303 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 YEF3YLR249W 3135 nt2.53□□□□□ -2
RTP1Q12751 TAE2YPL009C 3117 nt2.53□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 GIC1YHR061C 945 nt2.52□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 PEP8YJL053W 1140 nt2.52□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 ILM1YJR118C 612 nt2.52□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 VPS20YMR077C 666 nt2.52□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 SWS2YNL081C 432 nt2.52□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 ATX2YOR079C 942 nt2.52□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YBR209WYBR209W 318 nt2.52□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 AHC2YCR082W 387 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YGL015CYGL015C 393 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 LAG1YHL003C 1236 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 CIC1YHR052W 1131 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YIR020CYIR020C 303 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YHC1YLR298C 696 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YLR456WYLR456W 615 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 BRO1YPL084W 2535 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 DPB11YJL090C 2295 nt2.51□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 NCL1YBL024W 2055 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.5□□□□□ -2.01
RTP1Q12751 PRM8YGL053W 714 nt2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 119.8 ms