Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00205P59089 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms