Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PFDN5Q99471 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms