Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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