Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM28Q13263 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM28Q13263 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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