Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 SGS1YMR190C 4344 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 UBP11YKR098C 2154 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 RRP12YPL012W 3687 nt2.23□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 NEO1YIL048W 3456 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 YCR064CYCR064C 411 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 AHC2YCR082W 387 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 MPH1YIR002C 2982 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 RAM2YKL019W 951 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SHE2YKL130C 741 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 SPP41YDR464W 4308 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 RAV1YJR033C 4074 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 FKS3YMR306W 5358 nt2.22□□□□□ -2.05
NFI1Q12216 STD1YOR047C 1335 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YDL009CYDL009C 324 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 VPS74YDR372C 1038 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 NCB2YDR397C 441 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 TDA2YER071C 381 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 IST3YIR005W 447 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 SDS22YKL193C 1017 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 GIM3YNL153C 390 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YPL034WYPL034W 498 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YCL002CYCL002C 792 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 NIC96YFR002W 2520 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 VPH1YOR270C 2523 nt2.21□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 MGM1YOR211C 2646 nt2.2□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 snR59snR59 78 nt2.2□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 UBC5YDR059C 447 nt2.2□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YJR023CYJR023C 402 nt2.2□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YLR379WYLR379W 375 nt2.2□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 SLM4YBR077C 489 nt2.2□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 SLN1YIL147C 3663 nt2.2□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 SCH9YHR205W 2475 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 SCD5YOR329C 2619 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 FAR7YFR008W 666 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 RPL29YFR032C-A 180 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 MSL1YIR009W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YOR364WYOR364W 369 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 MGR1YCL044C 1254 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 GRR1YJR090C 3456 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 BUD2YKL092C 3315 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 REV1YOR346W 2958 nt2.19□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 NDD1YOR372C 1665 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 TOR2YKL203C 7425 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 CDC53YDL132W 2448 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 AGC1YPR021C 2709 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 IRC2YDR112W 309 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YIL058WYIL058W 285 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 HYR1YIR037W 492 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 EMC6YLL014W 327 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 HHT2YNL031C 411 nt2.18□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 TRL1YJL087C 2484 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 TMN3YER113C 2121 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YGL165CYGL165C 579 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 SPO11YHL022C 1197 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 HRI1YLR301W 735 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 PDP3YLR455W 915 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YLR458WYLR458W 381 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 RIO2YNL207W 1278 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 ATX2YOR079C 942 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 RUD3YOR216C 1455 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 NCL1YBL024W 2055 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 DNA2YHR164C 4569 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 PDR11YIL013C 4236 nt2.17□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 TAE2YPL009C 3117 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 IPT1YDR072C 1584 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 CDC50YCR094W 1176 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YDR115WYDR115W 318 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 LAG1YHL003C 1236 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 PRS3YHL011C 963 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 ACF4YJR083C 930 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 TAP42YMR028W 1101 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 YNL150WYNL150W 408 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 TOA1YOR194C 861 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 GRX5YPL059W 453 nt2.16□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 DIS3YOL021C 3006 nt2.15□□□□□ -2.06
NFI1Q12216 SSF2YDR312W 1362 nt2.15□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.15□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 LCL2YLR104W 396 nt2.15□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YPR170CYPR170C 336 nt2.15□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 TRS20YBR254C 528 nt2.15□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 BUB1YGR188C 3066 nt2.15□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 JIP5YPR169W 1479 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 GIP3YPL137C 3831 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 NAN1YPL126W 2691 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YDR537CYDR537C 606 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 AAD16YFL057C 459 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 GET1YGL020C 708 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 RAD6YGL058W 519 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 SRP21YKL122C 504 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 UBC12YLR306W 567 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 SWM2YNR004W 441 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 YOR333CYOR333C 417 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 ATG9YDL149W 2994 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 CDC60YPL160W 3273 nt2.14□□□□□ -2.07
NFI1Q12216 LRE1YCL051W 1752 nt2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.6 ms