Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RUNX1Q01196 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX1Q01196 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms