Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHKA1P46020 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHKA1P46020 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms