Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD21O60216 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD21O60216 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD21O60216 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD21O60216 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD21O60216 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD21O60216 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD21O60216 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD21O60216 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD21O60216 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms