Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QLW9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QLW9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QLW9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QLW9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QLW9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
J3QLW9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms