Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOP58Q9Y2X3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NOP58Q9Y2X3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms