Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXD3Q9UJU5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms