Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
EEA1Q15075 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
EEA1Q15075 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
EEA1Q15075 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
EEA1Q15075 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
EEA1Q15075 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
EEA1Q15075 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
EEA1Q15075 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EEA1Q15075 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms