Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 POL2YNL262W 6669 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YSP2YDR326C 4317 nt2.96□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YER181CYER181C 324 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 MRPL38YKL170W 417 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RPS1AYLR441C 768 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 BSC3YLR465C 309 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 SMA2YML066C 1110 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YBL065WYBL065W 345 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YPL142CYPL142C 318 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YPL197CYPL197C 414 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 VAC8YEL013W 1737 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RCY1YJL204C 2523 nt2.95□□□□□ -1.94 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPP382YLR424W 2127 nt2.95□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YPL216WYPL216W 3309 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 BCH1YMR237W 2175 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 CDH1YGL003C 1701 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YJL169WYJL169W 369 nt2.94□□□□□ -1.94 RIP-Chip
PUF2Q12221 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 CWC24YLR323C 780 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 COX8YLR395C 237 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 PKR1YMR123W 369 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 SSN8YNL025C 972 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 SWM2YNR004W 441 nt2.94□□□□□ -1.94 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL134CYOL134C 390 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 PIS1YPR113W 663 nt2.94□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 STP2YHR006W 1626 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 PCK1YKR097W 1650 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 ARV1YLR242C 966 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YLR269CYLR269C 351 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RRD2YPL152W 1077 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RPN1YHR027C 2982 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 SMC2YFR031C 3513 nt2.93□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 MSH4YFL003C 2637 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 MAK5YBR142W 2322 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 HOP1YIL072W 1818 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YCR090CYCR090C 549 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RPL27BYDR471W 411 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 AST2YER101C 1293 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YGR053CYGR053C 852 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 NBL1YHR199C-A 222 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 DFG10YIL049W 762 nt2.92□□□□□ -1.94 RIP-Chip
PUF2Q12221 YAL037WYAL037W 804 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 SRL3YKR091W 741 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RPL6AYML073C 531 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YBR032WYBR032W 303 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 VID24YBR105C 1089 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 PMR1YGL167C 2853 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 MAL33YBR297W 1407 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 FUN30YAL019W 3396 nt2.92□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 CWH41YGL027C 2502 nt2.91□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 YDR338CYDR338C 2088 nt2.91□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 ORC1YML065W 2745 nt2.91□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 UNG1YML021C 1080 nt2.91□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 PRE8YML092C 753 nt2.91□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 PBS2YJL128C 2007 nt2.91□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 VAS1YGR094W 3315 nt2.91□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RPA190YOR341W 4995 nt2.9□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 TOM70YNL121C 1854 nt2.9□□□□□ -1.94
PUF2Q12221 RRM3YHR031C 2172 nt2.9□□□□□ -1.94 RIP-Chip
PUF2Q12221 FAR1YJL157C 2493 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 CDC50YCR094W 1176 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YDR442WYDR442W 393 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 TCD1YHR003C 1290 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RPS21BYJL136C 264 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RRT16YNL105W 429 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RPL23AYBL087C 414 nt2.9□□□□□ -1.95 RIP-Chip
PUF2Q12221 MSL5YLR116W 1431 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 BNI4YNL233W 2679 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 GPI17YDR434W 1605 nt2.9□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 ERP6YGL002W 651 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YGL042CYGL042C 306 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YGR242WYGR242W 309 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 OTU2YHL013C 924 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YKL136WYKL136W 399 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 TEN1YLR010C 483 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 STN1YDR082W 1485 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 EXO84YBR102C 2262 nt2.89□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RMP1YLR145W 606 nt2.88□□□□□ -1.95 RIP-Chip
PUF2Q12221 DUF1YOL087C 3351 nt2.88□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 PDS5YMR076C 3834 nt2.88□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 SRB4YER022W 2064 nt2.88□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RIX1YHR197W 2292 nt2.88□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 DIA2YOR080W 2199 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 CGI121YML036W 546 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YML037CYML037C 1023 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 CDC33YOL139C 642 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 RPS12YOR369C 432 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YOR385WYOR385W 873 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YPL225WYPL225W 441 nt2.87□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 FLO1YAR050W 4614 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 YPS5YGL259W 498 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 TWF1YGR080W 999 nt2.86□□□□□ -1.95
PUF2Q12221 LSM8YJR022W 330 nt2.86□□□□□ -1.95 RIP-Chip
PUF2Q12221 YJR079WYJR079W 330 nt2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 306.4 ms