Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 TRM7YBR061C 933 nt1.38□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 MES1YGR264C 2256 nt1.38□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 DAL5YJR152W 1632 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 ESC2YDR363W 1371 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 HSE1YHL002W 1359 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 SNA4YDL123W 423 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 IRC4YDR540C 540 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 TMA7YLR262C-A 195 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 GSP1YLR293C 660 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 SRL4YPL033C 846 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YCL007CYCL007C 393 nt1.37□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YNL144CYNL144C 2223 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 RBK1YCR036W 1002 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YCR090CYCR090C 549 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 UBC9YDL064W 474 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 UBC5YDR059C 447 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 TVP15YDR100W 432 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 VAB2YEL005C 849 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 RTT107YHR154W 3213 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 TMA10YLR327C 261 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YML084WYML084W 309 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 URA5YML106W 681 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 SEN15YMR059W 387 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 COA6YMR244C-A 315 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 ATX1YNL259C 222 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YBR292CYBR292C 372 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 REV1YOR346W 2958 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 PKH3YDR466W 2697 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 BUD2YKL092C 3315 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 CFT2YLR115W 2580 nt1.36□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 MET18YIL128W 3099 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 GTR2YGR163W 1026 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 RPL16BYNL069C 597 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YBR013CYBR013C 390 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 PSO2YMR137C 1986 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YJL070CYJL070C 2667 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 HER1YOR227W 3741 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 CAT2YML042W 2013 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 CDC37YDR168W 1521 nt1.35□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 NIC96YFR002W 2520 nt1.34□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 PET127YOR017W 2403 nt1.34□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt1.34□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 YGL024WYGL024W 336 nt1.34□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 ATG16YMR159C 453 nt1.34□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 FIG2YCR089W 4830 nt1.34□□□□□ -2.19
ATG41Q12048 CCH1YGR217W 6120 nt1.34□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 GIC2YDR309C 1152 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 RPN9YDR427W 1182 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YEL010WYEL010W 351 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 MEI4YER044C-A 1227 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 RPL11BYGR085C 525 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YKL115CYKL115C 393 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 IRC13YOR235W 315 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 RPL11AYPR102C 525 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YBR090CYBR090C 369 nt1.33□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 MEC1YBR136W 7107 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 SLD5YDR489W 885 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 TPM2YIL138C 486 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 AIM23YJL131C 1071 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 SHE2YKL130C 741 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 SYM1YLR251W 594 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 GIM3YNL153C 390 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YOR333CYOR333C 417 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YCL023CYCL023C 348 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 APA1YCL050C 966 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 SRP1YNL189W 1629 nt1.32□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YDR338CYDR338C 2088 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 HCS1YKL017C 2052 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 HSL1YKL101W 4557 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 HSH155YMR288W 2916 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YDR336WYDR336W 945 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 ATG38YLR211C 681 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 GRE2YOL151W 1029 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 SIR4YDR227W 4077 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 RSM23YGL129C 1353 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 ARP5YNL059C 2268 nt1.31□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 RPL37BYDR500C 267 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 AIM18YHR198C 966 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YJL147CYJL147C 1149 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 VPS25YJR102C 609 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 MRPL44YMR225C 297 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YIP3YNL044W 531 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 MIX23YBL107C 591 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 TOA1YOR194C 861 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 BRR2YER172C 6492 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 FYV8YGR196C 2454 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 SLK19YOR195W 2466 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 MNE1YOR350C 1992 nt1.3□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 ATP16YDL004W 483 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YDR018CYDR018C 1191 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YFR056CYFR056C 369 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YIL102CYIL102C 306 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 RPA34YJL148W 702 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 YLR053CYLR053C 327 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 LSM2YBL026W 288 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 ATX2YOR079C 942 nt1.29□□□□□ -2.2
ATG41Q12048 AME1YBR211C 975 nt1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.4 ms