Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 SNF12YNR023W 1701 nt2.65□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 MED1YPR070W 1701 nt2.65□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RTS3YGR161C 792 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 AIM36YMR157C 768 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 CAT5YOR125C 702 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YOR385WYOR385W 873 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 ARR2YPR200C 393 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 PUF6YDR496C 1971 nt2.65□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 NMA111YNL123W 2994 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YKL100CYKL100C 1764 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 ESL2YKR096W 3588 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 HAA1YPR008W 2085 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 VHR2YER064C 1518 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 TOM1YDR457W 9807 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 PPH3YDR075W 927 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 AST2YER101C 1293 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 PNC1YGL037C 651 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 BAT1YHR208W 1182 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 LEE1YPL054W 906 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 ALG14YBR070C 714 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 snR54snR54 86 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 EXO84YBR102C 2262 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 DYN1YKR054C 12279 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 TOM70YNL121C 1854 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 PAM1YDR251W 2493 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 SMC2YFR031C 3513 nt2.64□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 CAF120YNL278W 3183 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YIL169CYIL169C 2988 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RRT13YER066W 558 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RPL29YFR032C-A 180 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 TCD1YHR003C 1290 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YLR101CYLR101C 396 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 CMC2YBL059C-A 330 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YNL046WYNL046W 519 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 NOP15YNL110C 663 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 MSS18YPR134W 807 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 SOK1YDR006C 2706 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 ECM29YHL030W 5607 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YCL019WYCL019W 5313 nt2.63□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 BOI1YBL085W 2943 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YGR067CYGR067C 2415 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 CDC55YGL190C 1581 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 BNR1YIL159W 4128 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 APC11YDL008W 498 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 FYV4YHR059W 393 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 VPH2YKL119C 648 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YLR334CYLR334C 381 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 SWM2YNR004W 441 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 HSP10YOR020C 321 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 CDC20YGL116W 1833 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 PPN1YDR452W 2025 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YPL216WYPL216W 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 UTP13YLR222C 2454 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RAD6YGL058W 519 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YPS5YGL259W 498 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RNR4YGR180C 1038 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 APC9YLR102C 798 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 TIF11YMR260C 462 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 BPT1YLL015W 4680 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 FLO11YIR019C 4104 nt2.61□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 SRB8YCR081W 4284 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 SEN54YPL083C 1404 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 KIN82YCR091W 2163 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 MRH1YDR033W 963 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YER079WYER079W 633 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YGR107WYGR107W 450 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RPL6AYML073C 531 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YPL080CYPL080C 327 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RAX2YLR084C 3663 nt2.6□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 CWC22YGR278W 1734 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 RGC1YPR115W 3252 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 GIM4YEL003W 336 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 HPA3YEL066W 540 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 IES5YER092W 378 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YHR125WYHR125W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YLR012CYLR012C 300 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YLR269CYLR269C 351 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 YPL261CYPL261C 309 nt2.59□□□□□ -1.99
SSK1Q07084 ROG1YGL144C 2058 nt2.59□□□□□ -2
SSK1Q07084 GYP7YDL234C 2241 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 RIX1YHR197W 2292 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 SKT5YBL061C 2091 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.58□□□□□ -2
SSK1Q07084 SMB1YER029C 591 nt2.58□□□□□ -2
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