Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00205P59089 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00205P59089 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms