Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 OST6YML019W 999 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 RPL16BYNL069C 597 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 NUP159YIL115C 4383 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 IKS1YJL057C 2004 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 RNA14YMR061W 2034 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 SRS2YJL092W 3525 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 TAF1YGR274C 3201 nt2.42□□□□□ -2.02
GIS2P53849 YDR338CYDR338C 2088 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 APC5YOR249C 2058 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 CDC45YLR103C 1953 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 YLL032CYLL032C 2478 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 VPS9YML097C 1356 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 TRX3YCR083W 384 nt2.41□□□□□ -2.02 RIP-Chip
GIS2P53849 YDL062WYDL062W 426 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 YDR442WYDR442W 393 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 YJL135WYJL135W 318 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 YJL150WYJL150W 303 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 PSY1YKL076C 384 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 PRE8YML092C 753 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 HUB1YNR032C-A 222 nt2.41□□□□□ -2.02 RIP-Chip
GIS2P53849 HSP10YOR020C 321 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 OM14YBR230C 405 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 SCW11YGL028C 1629 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 SKM1YOL113W 1968 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 ASI1YMR119W 1875 nt2.41□□□□□ -2.02 RIP-Chip
GIS2P53849 GRS2YPR081C 1857 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 SYF1YDR416W 2580 nt2.41□□□□□ -2.02
GIS2P53849 CEP3YMR168C 1827 nt2.4□□□□□ -2.02
GIS2P53849 SWI1YPL016W 3945 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 ALG13YGL047W 609 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 NOP19YGR251W 591 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RPL40AYIL148W 387 nt2.4□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 PAU14YIL176C 363 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 PAU1YJL223C 363 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RPA12YJR063W 378 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YNL179CYNL179C 438 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 GIP4YAL031C 2283 nt2.4□□□□□ -2.03
GIS2P53849 VAC14YLR386W 2643 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 SIP1YDR422C 2448 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 TRS120YDR407C 3870 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 BYE1YKL005C 1785 nt2.39□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 RKM1YPL208W 1752 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 ALR2YFL050C 2577 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 OAF1YAL051W 3144 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RAD26YJR035W 3258 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YEL1YBL060W 2064 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RPS21BYJL136C 264 nt2.39□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 MBB1YJL199C 327 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 TAR1YLR154W-C 375 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 SLM6YBR266C 453 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YJR030CYJR030C 2238 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 NPR2YEL062W 1848 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YSW1YBR148W 1830 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RPA190YOR341W 4995 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YBR238CYBR238C 2196 nt2.39□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YKL100CYKL100C 1764 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RIF1YBR275C 5751 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 SNX41YDR425W 1878 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 ERG28YER044C 447 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 PUT2YHR037W 1728 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 TMA19YKL056C 504 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 PRP39YML046W 1890 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 PEX6YNL329C 3093 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YBR064WYBR064W 429 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 NUP133YKR082W 3474 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 SEC6YIL068C 2418 nt2.38□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RDS1YCR106W 2499 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 MVP1YMR004W 1536 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 EPO1YMR124W 2832 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RSC3YDR303C 2658 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 PCF11YDR228C 1881 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 ULP1YPL020C 1866 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 RRP5YMR229C 5190 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RAD61YDR014W 1944 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 SPT10YJL127C 1923 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 UBP12YJL197W 3765 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 SSM4YIL030C 3960 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RPS13YDR064W 456 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 MTC3YGL226W 372 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 YGR164WYGR164W 336 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 URM1YIL008W 300 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 GPI14YJR013W 1212 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 ANB1YJR047C 474 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RPL26AYLR344W 384 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 YBL028CYBL028C 321 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 TVP18YMR071C 504 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
GIS2P53849 YPL080CYPL080C 327 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 DAN4YJR151C 3486 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 OSW7YFR039C 1533 nt2.37□□□□□ -2.03
GIS2P53849 RSE1YML049C 4086 nt2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 91.4 ms