Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1CQ15572 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
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