Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 SCP160YJL080C 3669 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 UBR1YGR184C 5853 nt2.01□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YCR108CYCR108C 192 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 SEC31YDL195W 3822 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 BUD26YDR241W 288 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 EMC6YLL014W 327 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YML090WYML090W 387 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 SLM4YBR077C 489 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 MSL5YLR116W 1431 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 CST9YLR394W 1449 nt2□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 MFB1YDR219C 1398 nt1.99□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 NEJ1YLR265C 1029 nt1.99□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 DGK1YOR311C 873 nt1.99□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 PET20YPL159C 762 nt1.99□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 SHG1YBR258C 429 nt1.99□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 MPH1YIR002C 2982 nt1.99□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 DAL5YJR152W 1632 nt1.99□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 TOR2YKL203C 7425 nt1.98□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 GIP3YPL137C 3831 nt1.98□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YCR090CYCR090C 549 nt1.98□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 RPS17BYDR447C 411 nt1.98□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YOL162WYOL162W 648 nt1.98□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 MES1YGR264C 2256 nt1.97□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 snR70snR70 164 nt1.97□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 RUB1YDR139C 234 nt1.97□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 SVP26YHR181W 687 nt1.97□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YBL012CYBL012C 402 nt1.97□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 YOR331CYOR331C 558 nt1.97□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 STI1YOR027W 1770 nt1.97□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 DNA2YHR164C 4569 nt1.96□□□□□ -2.09
MSH5Q12175 SAP190YKR028W 3102 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 UTP5YDR398W 1932 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YDR262WYDR262W 819 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YGR053CYGR053C 852 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 FYV4YHR059W 393 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 CTK2YJL006C 972 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YLR224WYLR224W 1110 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YBR197CYBR197C 654 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YBR277CYBR277C 402 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 IST2YBR086C 2841 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 PES4YFR023W 1836 nt1.96□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 NGG1YDR176W 2109 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 ATC1YDR184C 885 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 MIC19YFR011C 513 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 PCL5YHR071W 690 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 SUI2YJR007W 915 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 VTI1YMR197C 654 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 RRP15YPR143W 753 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 snR24snR24 89 nt1.95□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YCR099CYCR099C 468 nt1.94□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 RPL22BYFL034C-A 369 nt1.94□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 MUD1YBR119W 897 nt1.94□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 HSE1YHL002W 1359 nt1.94□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YJL070CYJL070C 2667 nt1.94□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 NUP170YBL079W 4509 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 SLU7YDR088C 1149 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 VPS51YKR020W 495 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YKR051WYKR051W 1257 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YMR144WYMR144W 1029 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YBR062CYBR062C 543 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 RRP6YOR001W 2202 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 LRE1YCL051W 1752 nt1.93□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 ATP16YDL004W 483 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 PRE1YER012W 597 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 GPX1YKL026C 504 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 SMD2YLR275W 333 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 TRM7YBR061C 933 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 CIN2YPL241C 807 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 PSO2YMR137C 1986 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 NAB6YML117W 3405 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 SSE1YPL106C 2082 nt1.92□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 CDC37YDR168W 1521 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 SIR4YDR227W 4077 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YCR016WYCR016W 873 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 OST5YGL226C-A 261 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YPS5YGL259W 498 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 EST3YIL009C-A 546 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 AIM19YIL087C 474 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 RFA3YJL173C 369 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 YLR379WYLR379W 375 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 PRE8YML092C 753 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 MIX23YBL107C 591 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 CUR1YPR158W 759 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 ARR2YPR200C 393 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 AME1YBR211C 975 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 UTP22YGR090W 3714 nt1.91□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 PDR3YBL005W 2931 nt1.9□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 RTT101YJL047C 2529 nt1.9□□□□□ -2.1
MSH5Q12175 SSF1YHR066W 1362 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 RAV2YDR202C 1056 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 SRB7YDR308C 423 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 YGR226CYGR226C 210 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 RPS30AYLR287C-A 192 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 PEX27YOR193W 1131 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 VPH1YOR270C 2523 nt1.9□□□□□ -2.11
MSH5Q12175 PRK1YIL095W 2433 nt1.9□□□□□ -2.11
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