Protein–RNA interactions for Protein: P53840

TOF1, Topoisomerase 1-associated factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOF1P53840 YML039WYML039W 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YML045WYML045W 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YMR050CYMR050C 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 TRM2YKR056W 1920 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 NTF2YER009W 378 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 ERV1YGR029W 570 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 RPL17BYJL177W 555 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 LCL1YPL056C 306 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 GCV2YMR189W 3105 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 BUB1YGR188C 3066 nt2.76□□□□□ -1.97
TOF1P53840 NUM1YDR150W 8247 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 FIR1YER032W 2631 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 GEA1YJR031C 4227 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 PTP3YER075C 2787 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 ASI3YNL008C 2031 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 SRD1YCR018C 666 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YDL016CYDL016C 303 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YDR262WYDR262W 819 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 PEA2YER149C 1263 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 MVB12YGR206W 306 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YJL119CYJL119C 324 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 RIM13YMR154C 2184 nt2.75□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YCR108CYCR108C 192 nt2.74□□□□□ -1.97
TOF1P53840 SLX9YGR081C 633 nt2.74□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.74□□□□□ -1.97
TOF1P53840 ASG7YJL170C 630 nt2.74□□□□□ -1.97
TOF1P53840 RBL2YOR265W 321 nt2.74□□□□□ -1.97
TOF1P53840 PDR1YGL013C 3207 nt2.74□□□□□ -1.97
TOF1P53840 SLK19YOR195W 2466 nt2.74□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YGR290WYGR290W 444 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 LRP1YHR081W 555 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 SYS1YJL004C 612 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 EMC6YLL014W 327 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 RPL16BYNL069C 597 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 ATP19YOL077W-A 207 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YDR186CYDR186C 2634 nt2.73□□□□□ -1.97
TOF1P53840 PDR3YBL005W 2931 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 NCB2YDR397C 441 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 ERG28YER044C 447 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 FAR7YFR008W 666 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 NEL1YHR035W 1893 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 SDL1YIL167W 633 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 ATX1YNL259C 222 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YOR050CYOR050C 348 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 SEC66YBR171W 621 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 MBA1YBR185C 837 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 BRE5YNR051C 1548 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 MRD1YPR112C 2664 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 ESC1YMR219W 4977 nt2.72□□□□□ -1.97
TOF1P53840 SWR1YDR334W 4545 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 TDA2YER071C 381 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 PCL5YHR071W 690 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YLR257WYLR257W 966 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 ATP18YML081C-A 180 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 TAP42YMR028W 1101 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 MRPL33YMR286W 261 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 ARP8YOR141C 2646 nt2.71□□□□□ -1.98
TOF1P53840 APC2YLR127C 2562 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 MAL33YBR297W 1407 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YDL187CYDL187C 330 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YDR209CYDR209C 414 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 RPL11BYGR085C 525 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YIL012WYIL012W 342 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 ILM1YJR118C 612 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 VPS63YLR261C 327 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YLR379WYLR379W 375 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YOL134CYOL134C 390 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YOR055WYOR055W 435 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 RPL11AYPR102C 525 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 NTC20YBR188C 423 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.7□□□□□ -1.98
TOF1P53840 NFT1YKR103W 3657 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YDR115WYDR115W 318 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YGR228WYGR228W 345 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 SCEIQ0160 708 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 UBX4YMR067C 1251 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 RUF22RUF22 515 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 PET123YOR158W 957 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YPR177CYPR177C 372 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 snR191snR191 274 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 SPB1YCL054W 2526 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 AFR1YDR085C 1863 nt2.69□□□□□ -1.98
TOF1P53840 ATP6Q0085 780 nt2.68□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.68□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YIL029CYIL029C 429 nt2.68□□□□□ -1.98
TOF1P53840 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.68□□□□□ -1.98
TOF1P53840 CWC24YLR323C 780 nt2.68□□□□□ -1.98
TOF1P53840 SWS2YNL081C 432 nt2.68□□□□□ -1.98
TOF1P53840 CSI2YOL007C 1026 nt2.68□□□□□ -1.98
TOF1P53840 COQ10YOL008W 624 nt2.68□□□□□ -1.98
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