Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFLP07196 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFLP07196 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFLP07196 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFLP07196 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFLP07196 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFLP07196 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms