Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
J3KRW8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
J3KRW8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
J3KRW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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