Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INPP4AQ96PE3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INPP4AQ96PE3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms