Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF21AQ96BD5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms