Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CARD17Q5XLA6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CARD17Q5XLA6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms