Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF4Q2M2E3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms