Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIGQ13278 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIGQ13278 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIGQ13278 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIGQ13278 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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