Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTP4A2Q12974 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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