Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC63Q05C16 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC63Q05C16 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms