Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 ARC18YLR370C 537 nt2.9□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RPS29AYLR388W 171 nt2.9□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YBL108WYBL108W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 HSP10YOR020C 321 nt2.9□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YOR277CYOR277C 309 nt2.9□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YNL193WYNL193W 1677 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SAK1YER129W 3429 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RLI1YDR091C 1827 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 MXR1YER042W 555 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YKE2YLR200W 345 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 UBX4YMR067C 1251 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 MRPL44YMR225C 297 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RPL16BYNL069C 597 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 GIM3YNL153C 390 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 MRPL40YPL173W 894 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 ORC2YBR060C 1863 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YPR170CYPR170C 336 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 KRE33YNL132W 3171 nt2.89□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 BRE5YNR051C 1548 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 FAR11YNL127W 2862 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 ATG13YPR185W 2217 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 TFB1YDR311W 1929 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 snR56snR56 88 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YCR001WYCR001W 315 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 snR84snR84 550 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SLD5YDR489W 885 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 MVB12YGR206W 306 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 BAT1YHR208W 1182 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 MCR1YKL150W 909 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 TPK3YKL166C 1197 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YLL044WYLL044W 447 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 CDC123YLR215C 1083 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 ORC1YML065W 2745 nt2.88□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 NOP12YOL041C 1380 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 DYN1YKR054C 12279 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 GCD6YDR211W 2139 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 UBP14YBR058C 2346 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 JJJ2YJL162C 1752 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 BTT1YDR252W 450 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 MTC7YEL033W 420 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YLR257WYLR257W 966 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YLR297WYLR297W 390 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RPL6AYML073C 531 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YPL107WYPL107W 747 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YRO2YBR054W 1035 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SLK19YOR195W 2466 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 BUB1YGR188C 3066 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RIM13YMR154C 2184 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 NSA1YGL111W 1392 nt2.87□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SIR3YLR442C 2937 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 BOI1YBL085W 2943 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SEN54YPL083C 1404 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 FIR1YER032W 2631 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 VMA21YGR105W 234 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YET1YKL065C 621 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 TMA10YLR327C 261 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 NGL1YOL042W 1092 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 INO80YGL150C 4470 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YCT1YLL055W 1596 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RPA190YOR341W 4995 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YOL057WYOL057W 2136 nt2.86□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 GCV2YMR189W 3105 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 snR9snR9 187 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 NCB2YDR397C 441 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SDL1YIL167W 633 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YPR050CYPR050C 414 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SHG1YBR258C 429 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 ERG11YHR007C 1593 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YCL020WYCL020W 1317 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 BIT61YJL058C 1632 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 ASI3YNL008C 2031 nt2.85□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 ILS1YBL076C 3219 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 GYP7YDL234C 2241 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SUL1YBR294W 2580 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RIF1YBR275C 5751 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 PRE4YFR050C 801 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YGR053CYGR053C 852 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RSR1YGR152C 819 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YHR213WYHR213W 597 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 YAR062WYAR062W 597 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SMA2YML066C 1110 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SWS2YNL081C 432 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 ATX1YNL259C 222 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RPL23AYBL087C 414 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SPC29YPL124W 762 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 RPL33AYPL143W 324 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 CUR1YPR158W 759 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 MBA1YBR185C 837 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 BPT1YLL015W 4680 nt2.84□□□□□ -1.95
HEL2Q05580 SRB4YER022W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.5 ms