Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX1Q01196 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms