Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YDL158C	YDL158C	309 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	BRP1	YGL007W	378 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SAE2	YGL175C	1038 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	VMA7	YGR020C	357 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SVP26	YHR181W	687 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ATG10	YLL042C	504 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YNL050C	YNL050C	813 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	RPL16B	YNL069C	597 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ARF3	YOR094W	552 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SSD1	YDR293C	3753 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	UTP22	YGR090W	3714 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ASI3	YNL008C	2031 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	Q0255	Q0255	1419 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	CST9	YLR394W	1449 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SSE1	YPL106C	2082 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	IRC8	YJL051W	2469 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	GCN4	YEL009C	846 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YFL015C	YFL015C	495 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	MVB12	YGR206W	306 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	GOS1	YHL031C	672 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	EST3	YIL009C-A	546 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	RPL17B	YJL177W	555 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YKL069W	YKL069W	543 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	FPR1	YNL135C	345 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YOR097C	YOR097C	528 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YOR277C	YOR277C	309 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	MSS18	YPR134W	807 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	BNI1	YNL271C	5862 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	CLN3	YAL040C	1743 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	KAP123	YER110C	3342 nt		2.24	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	NOP12	YOL041C	1380 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	APC2	YLR127C	2562 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	NUR1	YDL089W	1455 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YLR108C	YLR108C	1458 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SRD1	YCR018C	666 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	RUB1	YDR139C	234 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	KEI1	YDR367W	666 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YFL012W	YFL012W	447 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	PEX17	YNL214W	600 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	INO80	YGL150C	4470 nt		2.23	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YGL176C	YGL176C	1665 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SLD5	YDR489W	885 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	COX6	YHR051W	447 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	COQ10	YOL008W	624 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ISU1	YPL135W	498 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YEL1	YBL060W	2064 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SAP185	YJL098W	3177 nt		2.22	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SRB7	YDR308C	423 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	OST5	YGL226C-A	261 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	MRP49	YKL167C	414 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YKE2	YLR200W	345 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	SMD2	YLR275W	333 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YBR090C	YBR090C	369 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.21	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	MAL33	YBR297W	1407 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	ATC1	YDR184C	885 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	HYP2	YEL034W	474 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	SPO11	YHL022C	1197 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	IKI1	YHR187W	930 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	GPX1	YKL026C	504 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YLR255C	YLR255C	354 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	CWC24	YLR323C	780 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	snR191	snR191	274 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	SEC66	YBR171W	621 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	FUS1	YCL027W	1539 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	ALK2	YBL009W	2031 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	NGG1	YDR176W	2109 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.2	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	ARP5	YNL059C	2268 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	BRE5	YNR051C	1548 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	EMP24	YGL200C	612 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YGL230C	YGL230C	444 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	NOP19	YGR251W	591 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YIL012W	YIL012W	342 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	IRC21	YMR073C	606 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	RRT16	YNL105W	429 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	CRS5	YOR031W	210 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	IPP1	YBR011C	864 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	HEM4	YOR278W	828 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	CIN2	YPL241C	807 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	TAZ1	YPR140W	1146 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	GDI1	YER136W	1356 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YKL075C	YKL075C	1353 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	UFD4	YKL010C	4452 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YFR016C	YFR016C	3702 nt		2.19	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	GPM2	YDL021W	936 nt		2.18	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		2.18	□□□□□ -2.06
ATG12	P38316	CTK2	YJL006C	972 nt		2.18	□□□□□ -2.06

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms