Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 SHS1YDL225W 1656 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 SWF1YDR126W 1011 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 MIC19YFR011C 513 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 MTC3YGL226W 372 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 RPL11BYGR085C 525 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 YHR138CYHR138C 345 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 YHR212CYHR212C 336 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 RPS21BYJL136C 264 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 RPL22AYLR061W 366 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 YAR060CYAR060C 336 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 YLR287CYLR287C 1068 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 SSN8YNL025C 972 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 ATX1YNL259C 222 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 RFC3YNL290W 1023 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 MPD2YOL088C 834 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 RPL11AYPR102C 525 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 PEX5YDR244W 1839 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 HBT1YDL223C 3141 nt2.67□□□□□ -1.98
AVT5P38176 REC8YPR007C 2043 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 TFC4YGR047C 3078 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 RPB9YGL070C 369 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 YOR392WYOR392W 444 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 snR54snR54 86 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 LCB4YOR171C 1875 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 BRE5YNR051C 1548 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 SPP382YLR424W 2127 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 VPS3YDR495C 3036 nt2.66□□□□□ -1.98
AVT5P38176 GWT1YJL091C 1473 nt2.65□□□□□ -1.98
AVT5P38176 STP2YHR006W 1626 nt2.65□□□□□ -1.98
AVT5P38176 MNT3YIL014W 1893 nt2.65□□□□□ -1.98
AVT5P38176 MUB1YMR100W 1863 nt2.65□□□□□ -1.98
AVT5P38176 SRD1YCR018C 666 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 RPS14AYCR031C 414 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 SNA4YDL123W 423 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YER135CYER135C 393 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 RTS3YGR161C 792 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YHR125WYHR125W 306 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YLR101CYLR101C 396 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 GPX2YBR244W 489 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 RIM13YMR154C 2184 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 FRE8YLR047C 2061 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 DSF2YBR007C 2211 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CIN8YEL061C 3003 nt2.65□□□□□ -1.99
AVT5P38176 KIN82YCR091W 2163 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 MAK5YBR142W 2322 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 KAR9YPL269W 1935 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 ESL1YIL151C 3357 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 DAS1YJL149W 1992 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 RIM9YMR063W 720 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 DYN3YMR299C 939 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CMC2YBL059C-A 330 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 NOP15YNL110C 663 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YNL146WYNL146W 303 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 PDR17YNL264C 1053 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YBR062CYBR062C 543 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YBR285WYBR285W 435 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 PAM1YDR251W 2493 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 BNI4YNL233W 2679 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 JSN1YJR091C 3276 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 HFM1YGL251C 3564 nt2.64□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YJL132WYJL132W 2253 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CDC55YGL190C 1581 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CHS3YBR023C 3498 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 OPI6YDL096C 327 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YGR017WYGR017W 894 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 BIG1YHR101C 1008 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 AGE2YIL044C 897 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YJL086CYJL086C 369 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YLR076CYLR076C 423 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CWC24YLR323C 780 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 GOT1YMR292W 417 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YPL034WYPL034W 498 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YPL185WYPL185W 396 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YDR061WYDR061W 1620 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 PMR1YGL167C 2853 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 TIF4631YGR162W 2859 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 SPO14YKR031C 5052 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 UTP15YMR093W 1542 nt2.63□□□□□ -1.99
AVT5P38176 SSF1YHR066W 1362 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 HAA1YPR008W 2085 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 MET5YJR137C 4329 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 STI1YOR027W 1770 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YGL015CYGL015C 393 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 SPC1YJR010C-A 285 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 YLR230WYLR230W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
AVT5P38176 CDC20YGL116W 1833 nt2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.8 ms