Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2E1P29083 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms