Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEFLP07196 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEFLP07196 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEFLP07196 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFLP07196 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFLP07196 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFLP07196 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFLP07196 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFLP07196 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NEFLP07196 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEFLP07196 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEFLP07196 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEFLP07196 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms