Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KRW8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KRW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KRW8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KRW8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KRW8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KRW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3KRW8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3KRW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3KRW8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3KRW8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KRW8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KRW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KRW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KRW8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KRW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KRW8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3KRW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3KRW8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms