Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TNIKQ9UKE5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms