Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEFF2Q9UIK5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEFF2Q9UIK5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms