Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFCC1Q9HA90 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFCC1Q9HA90 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms