Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18Q15532 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SS18Q15532 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SS18Q15532 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SS18Q15532 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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