Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN4

KRT72, Keratin, type II cytoskeletal 72, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72Q14CN4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT72Q14CN4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT72Q14CN4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT72Q14CN4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT72Q14CN4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT72Q14CN4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT72Q14CN4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT72Q14CN4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms