Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 TPM2YIL138C 486 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 APC9YLR102C 798 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YPR050CYPR050C 414 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 TGL3YMR313C 1929 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 EPL1YFL024C 2499 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 PEX6YNL329C 3093 nt3.16□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YAK1YJL141C 2424 nt3.15□□□□□ -1.9 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPS6YIR039C 1614 nt3.15□□□□□ -1.9
PUF2Q12221 YGR017WYGR017W 894 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YAP3YHL009C 993 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 VMA10YHR039C-A 345 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YKL044WYKL044W 321 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 AFB1YLR040C 675 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RNH203YLR154C 333 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 CTK3YML112W 891 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPC40YPR110C 1008 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 ADY4YLR227C 1482 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 NDC80YIL144W 2076 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 FAA2YER015W 2235 nt3.15□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 MDM1YML104C 3384 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 CHO2YGR157W 2610 nt3.14□□□□□ -1.91 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR262WYDR262W 819 nt3.14□□□□□ -1.91 RIP-Chip
PUF2Q12221 CPR5YDR304C 678 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SMT3YDR510W 306 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YER087C-AYER087C-A 552 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YFL065CYFL065C 309 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YGL039WYGL039W 1047 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPL1BYGL135W 654 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YML084WYML084W 309 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YNL146WYNL146W 303 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YOL159CYOL159C 516 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPL1AYPL220W 654 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 MBA1YBR185C 837 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 PFK26YIL107C 2484 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SLK19YOR195W 2466 nt3.14□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SWC4YGR002C 1431 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 snR59snR59 78 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 ATG31YDR022C 591 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SMX2YFL017W-A 234 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YIL141WYIL141W 390 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 MCR1YKL150W 909 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RIM9YMR063W 720 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YNL184CYNL184C 327 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 AFT2YPL202C 1251 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 LTP1YPR073C 486 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 NCS2YNL119W 1482 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 DSF2YBR007C 2211 nt3.13□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 STE6YKL209C 3873 nt3.13□□□□□ -1.91 RIP-Chip
PUF2Q12221 MUD2YKL074C 1584 nt3.12□□□□□ -1.91 RIP-Chip
PUF2Q12221 SHE4YOR035C 2370 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 GCN1YGL195W 8019 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 XRN1YGL173C 4587 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SYO1YDL063C 1863 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YHR080CYHR080C 4038 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 HNT1YDL125C 477 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 ECO1YFR027W 846 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 PCL5YHR071W 690 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YHR212CYHR212C 336 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 TDA8YAL064C-A 381 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YAR060CYAR060C 336 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YLR224WYLR224W 1110 nt3.12□□□□□ -1.91 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YPL034WYPL034W 498 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YPR053CYPR053C 456 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 NMD2YHR077C 3270 nt3.12□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 DAL5YJR152W 1632 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 VAC14YLR386W 2643 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YKR078WYKR078W 1758 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SRD1YCR018C 666 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YGR073CYGR073C 372 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPS23AYGR118W 438 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 AIM29YKR074W 468 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 DAD2YKR083C 402 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RNP1YLL046C 750 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPL13BYMR142C 600 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YOL114CYOL114C 609 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RPS23BYPR132W 438 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 GPX2YBR244W 489 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 BMS1YPL217C 3552 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SRP68YPL243W 1800 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 ARO1YDR127W 4767 nt3.11□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 DRS2YAL026C 4068 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 RTS3YGR161C 792 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YHR125WYHR125W 306 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 SDP1YIL113W 630 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YIL175WYIL175W 318 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YIR040CYIR040C 333 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YLR101CYLR101C 396 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 MPD2YOL088C 834 nt3.1□□□□□ -1.91
PUF2Q12221 MSS18YPR134W 807 nt3.1□□□□□ -1.91
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