Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMB2P55268 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMB2P55268 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms