Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 MSS18YPR134W 807 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 CBP2YHL038C 1893 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 CEP3YMR168C 1827 nt3.54□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 PDS5YMR076C 3834 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 GDI1YER136W 1356 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 SEC15YGL233W 2733 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YER135CYER135C 393 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 USE1YGL098W 738 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 TPM2YIL138C 486 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 SPC1YJR010C-A 285 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 ARV1YLR242C 966 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 RAD33YML011C 534 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YNL058CYNL058C 951 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 YBR012CYBR012C 420 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 XRN1YGL173C 4587 nt3.53□□□□□ -1.84
SSZ1P38788 FOX2YKR009C 2703 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 TRS120YDR407C 3870 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 BMS1YPL217C 3552 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YGR017WYGR017W 894 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 OTU2YHL013C 924 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YHR125WYHR125W 306 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YHR138CYHR138C 345 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YJL169WYJL169W 369 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 OST2YOR103C 393 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 VID24YBR105C 1089 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 PBS2YJL128C 2007 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 CIN1YOR349W 3045 nt3.52□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 KIN2YLR096W 3444 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 NOG1YPL093W 1944 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YCR090CYCR090C 549 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 MGT1YDL200C 567 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 BCD1YHR040W 1101 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YAL037WYAL037W 804 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 CMC2YBL059C-A 330 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RRT16YNL105W 429 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 ROD1YOR018W 2514 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 JJJ2YJL162C 1752 nt3.51□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 SAF1YBR280C 1914 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 SSP1YHR184W 1716 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 AAD3YCR107W 1092 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RPS0AYGR214W 759 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 PET54YGR222W 882 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YIR040CYIR040C 333 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 DLS1YJL065C 504 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RPS28BYLR264W 204 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RRD2YPL152W 1077 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 IRC16YPR038W 360 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 VAC8YEL013W 1737 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RRP5YMR229C 5190 nt3.5□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 ENA2YDR039C 3276 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 ENA1YDR040C 3276 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YGL042CYGL042C 306 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 ECM15YBL001C 315 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 SHH3YMR118C 591 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 PKR1YMR123W 369 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 DAS1YJL149W 1992 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 PDR12YPL058C 4536 nt3.49□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YCK2YNL154C 1641 nt3.48□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 GLC7YER133W 939 nt3.48□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RPS4BYHR203C 786 nt3.48□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 OST6YML019W 999 nt3.48□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 SSL1YLR005W 1386 nt3.48□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.48□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 LCB4YOR171C 1875 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 MDN1YLR106C 14733 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 SPE1YKL184W 1401 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 SWF1YDR126W 1011 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 BET3YKR068C 582 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RMP1YLR145W 606 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YML084WYML084W 309 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 PEX11YOL147C 711 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 YOR053WYOR053W 342 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 TCB3YML072C 4638 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 SMC3YJL074C 3693 nt3.47□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 GYL1YMR192W 2163 nt3.46□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 RAD4YER162C 2265 nt3.46□□□□□ -1.85
SSZ1P38788 ALY1YKR021W 2748 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 CDC45YLR103C 1953 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 AIM7YDR063W 450 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 SDP1YIL113W 630 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 RIM11YMR139W 1113 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 YOR392WYOR392W 444 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 YBR285WYBR285W 435 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 RSC1YGR056W 2787 nt3.46□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 KHA1YJL094C 2622 nt3.45□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 YDL180WYDL180W 1644 nt3.45□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 YCG1YDR325W 3108 nt3.45□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 FAP7YDL166C 594 nt3.45□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 ATG31YDR022C 591 nt3.45□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 AHA1YDR214W 1053 nt3.45□□□□□ -1.86
SSZ1P38788 RPS26BYER131W 360 nt3.45□□□□□ -1.86
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