Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 YCK2YNL154C 1641 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 CDH1YGL003C 1701 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 VAS1YGR094W 3315 nt3.35□□□□□ -1.87
NIC96P34077 APC11YDL008W 498 nt3.35□□□□□ -1.87
NIC96P34077 EAF6YJR082C 342 nt3.35□□□□□ -1.87
NIC96P34077 AIM36YMR157C 768 nt3.35□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.35□□□□□ -1.87
NIC96P34077 HEM4YOR278W 828 nt3.35□□□□□ -1.87
NIC96P34077 VID24YBR105C 1089 nt3.35□□□□□ -1.87
NIC96P34077 MES1YGR264C 2256 nt3.34□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YDR199WYDR199W 366 nt3.34□□□□□ -1.87
NIC96P34077 VFA1YER128W 612 nt3.34□□□□□ -1.87
NIC96P34077 RSR1YGR152C 819 nt3.34□□□□□ -1.87
NIC96P34077 DAD2YKR083C 402 nt3.34□□□□□ -1.87
NIC96P34077 RRI2YOL117W 1938 nt3.34□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RDS1YCR106W 2499 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 PSK1YAL017W 4071 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YDL009CYDL009C 324 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 FAP7YDL166C 594 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 ERG28YER044C 447 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 USE1YGL098W 738 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 PXR1YGR280C 816 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YIR020CYIR020C 303 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 VPS51YKR020W 495 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 SEN15YMR059W 387 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 SAS2YMR127C 1017 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 PHO80YOL001W 882 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 snR191snR191 274 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RGL1YPL066W 1440 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 SEN54YPL083C 1404 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 PHR1YOR386W 1698 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 BOI1YBL085W 2943 nt3.33□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RRN6YBL014C 2685 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YIR040CYIR040C 333 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RAD33YML011C 534 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YNL324WYNL324W 396 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 OST2YOR103C 393 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YOR331CYOR331C 558 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 CDC55YGL190C 1581 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 CDC45YLR103C 1953 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 ICR1ICR1 3199 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 DUF1YOL087C 3351 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RPA135YPR010C 3612 nt3.32□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt3.31□□□□□ -1.88
NIC96P34077 GIM4YEL003W 336 nt3.31□□□□□ -1.88
NIC96P34077 AFB1YLR040C 675 nt3.31□□□□□ -1.88
NIC96P34077 ALG14YBR070C 714 nt3.31□□□□□ -1.88
NIC96P34077 COP1YDL145C 3606 nt3.31□□□□□ -1.88
NIC96P34077 BCH1YMR237W 2175 nt3.31□□□□□ -1.88
NIC96P34077 DAL5YJR152W 1632 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YMR018WYMR018W 1545 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 STE23YLR389C 3084 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 GLC3YEL011W 2115 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 SYM1YLR251W 594 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YPR012WYPR012W 255 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YPR096CYPR096C 303 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 PDC2YDR081C 2778 nt3.3□□□□□ -1.88
NIC96P34077 POM152YMR129W 4014 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 SSF1YHR066W 1362 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 IES6YEL044W 501 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 PRM8YGL053W 714 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RPS21BYJL136C 264 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 MRP49YKL167C 414 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 MRPL20YKR085C 588 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YLR334CYLR334C 381 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 ATX2YOR079C 942 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 MET5YJR137C 4329 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 ASM4YDL088C 1587 nt3.29□□□□□ -1.88
NIC96P34077 DSE4YNR067C 3354 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YOL057WYOL057W 2136 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YAP6YDR259C 1152 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YGL015CYGL015C 393 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 SPO13YHR014W 876 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 BAT1YHR208W 1182 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 COX19YLL018C-A 297 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 RPS28BYLR264W 204 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YHC1YLR298C 696 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 SLA1YBL007C 3735 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 YEL025CYEL025C 3567 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 STT4YLR305C 5703 nt3.28□□□□□ -1.88
NIC96P34077 BI4Q0120 1917 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 HNT1YDL125C 477 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 CWC2YDL209C 1020 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 DFG10YIL049W 762 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 YAL037WYAL037W 804 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 RIM11YMR139W 1113 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 YNL179CYNL179C 438 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 PRM3YPL192C 402 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 YPL261CYPL261C 309 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 RRG8YPR116W 834 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 RPB5YBR154C 648 nt3.27□□□□□ -1.89
NIC96P34077 BFR1YOR198C 1413 nt3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.7 ms