Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTNP21246 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTNP21246 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTNP21246 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTNP21246 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTNP21246 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTNP21246 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTNP21246 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTNP21246 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTNP21246 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms